素点による平均点とＧＰＡとで、成績順位の逆転現象が生じる可能性がある。愛媛大学においてシミュレーションを行った際には、このようなケースが多々見られた。
　例えば、各２単位の３科目で算出するとして、Ａ君の素点は７９点、７９点、７９点で合計２３７点の場合、GPAは（２点＋２点＋２点）×２単位÷（２単位×３科目）＝２．０となる。Ｂ君は９０点、７０点、６０点で合計２２０点、ＧＰＡは（４点＋２点＋１点）×２単位÷（２単位×３科目）≒２．３となる。素点の平均はＡ君７９点、Ｂ君７３．３点なので、逆転が起きている。
　これを防ぐために、functional ＧＰＡという算出方法がある。この方法だと素点からＧＰＡを算出するため、素点順位とＧＰＡ順位の逆転をほとんどなくすことが可能で、愛媛大学でのシミュレーションでも逆転現象は見られなかった。このようにfunctional ＧＰＡは活用価値があるのだが、残念ながら国際基準に合わせる場合は換算が必要であり、学内での成績評価において有効といえる。
　このように、わが国でのＧＰＡの本格的導入や信用できる数値としての公での利用には、まだまだ乗り越えなくてはならないハードルが多いといえる。